Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB2P80303 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB2P80303 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB2P80303 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUCB2P80303 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms