Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAE1P78406 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAE1P78406 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAE1P78406 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAE1P78406 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAE1P78406 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAE1P78406 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAE1P78406 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAE1P78406 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAE1P78406 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAE1P78406 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAE1P78406 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAE1P78406 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAE1P78406 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAE1P78406 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAE1P78406 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAE1P78406 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAE1P78406 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAE1P78406 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAE1P78406 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAE1P78406 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAE1P78406 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAE1P78406 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAE1P78406 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAE1P78406 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAE1P78406 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAE1P78406 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAE1P78406 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAE1P78406 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAE1P78406 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAE1P78406 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAE1P78406 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAE1P78406 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAE1P78406 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAE1P78406 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAE1P78406 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAE1P78406 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAE1P78406 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAE1P78406 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAE1P78406 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAE1P78406 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAE1P78406 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAE1P78406 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAE1P78406 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAE1P78406 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAE1P78406 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAE1P78406 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms