Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE2HP62256 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2HP62256 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE2HP62256 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE2HP62256 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms