Protein–RNA interactions for Protein: P61925

PKIA, cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIAP61925 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKIAP61925 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PKIAP61925 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKIAP61925 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKIAP61925 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKIAP61925 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKIAP61925 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKIAP61925 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKIAP61925 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKIAP61925 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKIAP61925 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKIAP61925 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKIAP61925 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKIAP61925 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKIAP61925 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKIAP61925 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKIAP61925 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKIAP61925 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKIAP61925 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKIAP61925 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKIAP61925 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKIAP61925 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKIAP61925 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKIAP61925 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKIAP61925 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKIAP61925 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKIAP61925 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKIAP61925 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKIAP61925 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKIAP61925 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKIAP61925 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKIAP61925 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKIAP61925 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKIAP61925 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKIAP61925 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKIAP61925 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKIAP61925 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKIAP61925 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKIAP61925 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKIAP61925 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKIAP61925 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKIAP61925 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKIAP61925 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKIAP61925 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKIAP61925 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKIAP61925 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKIAP61925 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms