Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK11-1P61568 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVK11-1P61568 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK11-1P61568 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms