Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTP1P59025 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTP1P59025 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTP1P59025 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTP1P59025 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTP1P59025 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTP1P59025 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTP1P59025 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTP1P59025 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTP1P59025 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTP1P59025 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTP1P59025 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTP1P59025 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTP1P59025 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP1P59025 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP1P59025 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP1P59025 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP1P59025 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP1P59025 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP1P59025 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP1P59025 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP1P59025 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP1P59025 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP1P59025 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP1P59025 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP1P59025 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP1P59025 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP1P59025 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP1P59025 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP1P59025 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP1P59025 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP1P59025 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP1P59025 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RTP1P59025 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP1P59025 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTP1P59025 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP1P59025 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP1P59025 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP1P59025 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP1P59025 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP1P59025 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP1P59025 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP1P59025 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP1P59025 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP1P59025 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP1P59025 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP1P59025 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP1P59025 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTP1P59025 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTP1P59025 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTP1P59025 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTP1P59025 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms