Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX10P56693 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX10P56693 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX10P56693 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX10P56693 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX10P56693 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX10P56693 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX10P56693 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX10P56693 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SOX10P56693 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX10P56693 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX10P56693 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX10P56693 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX10P56693 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX10P56693 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX10P56693 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX10P56693 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX10P56693 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX10P56693 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX10P56693 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX10P56693 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX10P56693 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX10P56693 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX10P56693 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX10P56693 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX10P56693 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX10P56693 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX10P56693 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX10P56693 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOX10P56693 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOX10P56693 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOX10P56693 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX10P56693 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX10P56693 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX10P56693 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX10P56693 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX10P56693 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX10P56693 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX10P56693 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX10P56693 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX10P56693 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX10P56693 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX10P56693 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX10P56693 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX10P56693 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX10P56693 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX10P56693 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX10P56693 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX10P56693 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX10P56693 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX10P56693 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX10P56693 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SOX10P56693 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX10P56693 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX10P56693 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX10P56693 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX10P56693 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX10P56693 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX10P56693 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX10P56693 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX10P56693 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX10P56693 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX10P56693 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX10P56693 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX10P56693 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX10P56693 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX10P56693 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX10P56693 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX10P56693 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX10P56693 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX10P56693 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX10P56693 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX10P56693 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX10P56693 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX10P56693 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms