Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH15P55291 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH15P55291 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH15P55291 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH15P55291 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH15P55291 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH15P55291 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH15P55291 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH15P55291 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH15P55291 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH15P55291 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH15P55291 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH15P55291 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH15P55291 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH15P55291 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH15P55291 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH15P55291 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH15P55291 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH15P55291 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH15P55291 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH15P55291 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH15P55291 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH15P55291 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH15P55291 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH15P55291 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH15P55291 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH15P55291 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH15P55291 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH15P55291 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH15P55291 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH15P55291 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH15P55291 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH15P55291 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH15P55291 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH15P55291 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH15P55291 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH15P55291 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH15P55291 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH15P55291 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH15P55291 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH15P55291 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH15P55291 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH15P55291 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH15P55291 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH15P55291 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH15P55291 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH15P55291 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH15P55291 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH15P55291 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH15P55291 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH15P55291 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH15P55291 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH15P55291 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH15P55291 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH15P55291 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH15P55291 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH15P55291 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH15P55291 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms