Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UCNP55089 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UCNP55089 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UCNP55089 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UCNP55089 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UCNP55089 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UCNP55089 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UCNP55089 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UCNP55089 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UCNP55089 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UCNP55089 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UCNP55089 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UCNP55089 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UCNP55089 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UCNP55089 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UCNP55089 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UCNP55089 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UCNP55089 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UCNP55089 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UCNP55089 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UCNP55089 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UCNP55089 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UCNP55089 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UCNP55089 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UCNP55089 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UCNP55089 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UCNP55089 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCNP55089 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCNP55089 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UCNP55089 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCNP55089 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCNP55089 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCNP55089 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCNP55089 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCNP55089 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCNP55089 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCNP55089 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCNP55089 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UCNP55089 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCNP55089 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCNP55089 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCNP55089 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCNP55089 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UCNP55089 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCNP55089 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCNP55089 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCNP55089 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCNP55089 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UCNP55089 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCNP55089 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCNP55089 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms