Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NAPAP54920 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NAPAP54920 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAPAP54920 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAPAP54920 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAPAP54920 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NAPAP54920 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NAPAP54920 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NAPAP54920 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NAPAP54920 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NAPAP54920 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAPAP54920 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAPAP54920 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAPAP54920 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAPAP54920 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NAPAP54920 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NAPAP54920 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAPAP54920 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAPAP54920 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAPAP54920 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAPAP54920 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAPAP54920 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NAPAP54920 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NAPAP54920 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NAPAP54920 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAPAP54920 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAPAP54920 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAPAP54920 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAPAP54920 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAPAP54920 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAPAP54920 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NAPAP54920 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NAPAP54920 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NAPAP54920 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAPAP54920 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAPAP54920 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAPAP54920 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAPAP54920 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAPAP54920 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAPAP54920 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAPAP54920 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAPAP54920 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAPAP54920 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAPAP54920 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAPAP54920 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAPAP54920 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAPAP54920 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAPAP54920 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAPAP54920 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NAPAP54920 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NAPAP54920 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAPAP54920 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAPAP54920 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAPAP54920 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAPAP54920 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAPAP54920 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NAPAP54920 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAPAP54920 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAPAP54920 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAPAP54920 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAPAP54920 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAPAP54920 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NAPAP54920 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAPAP54920 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAPAP54920 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAPAP54920 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAPAP54920 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAPAP54920 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAPAP54920 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAPAP54920 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAPAP54920 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NAPAP54920 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAPAP54920 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAPAP54920 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAPAP54920 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAPAP54920 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NAPAP54920 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAPAP54920 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAPAP54920 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAPAP54920 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAPAP54920 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAPAP54920 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAPAP54920 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAPAP54920 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAPAP54920 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAPAP54920 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms