Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB3P54284 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB3P54284 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms