Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMTP48728 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMTP48728 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMTP48728 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMTP48728 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMTP48728 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AMTP48728 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMTP48728 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AMTP48728 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMTP48728 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMTP48728 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMTP48728 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMTP48728 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMTP48728 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMTP48728 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMTP48728 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMTP48728 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMTP48728 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMTP48728 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMTP48728 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMTP48728 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMTP48728 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMTP48728 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMTP48728 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMTP48728 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMTP48728 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMTP48728 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AMTP48728 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMTP48728 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMTP48728 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMTP48728 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMTP48728 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMTP48728 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms