Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL21P46778 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL21P46778 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL21P46778 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL21P46778 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL21P46778 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPL21P46778 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL21P46778 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL21P46778 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL21P46778 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL21P46778 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL21P46778 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL21P46778 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL21P46778 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL21P46778 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL21P46778 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL21P46778 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL21P46778 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL21P46778 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL21P46778 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL21P46778 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL21P46778 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL21P46778 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL21P46778 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL21P46778 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL21P46778 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL21P46778 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL21P46778 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL21P46778 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL21P46778 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL21P46778 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL21P46778 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL21P46778 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL21P46778 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL21P46778 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL21P46778 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL21P46778 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL21P46778 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL21P46778 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL21P46778 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL21P46778 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL21P46778 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL21P46778 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL21P46778 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL21P46778 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPL21P46778 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL21P46778 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL21P46778 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL21P46778 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL21P46778 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL21P46778 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL21P46778 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL21P46778 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL21P46778 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL21P46778 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL21P46778 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL21P46778 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL21P46778 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL21P46778 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL21P46778 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL21P46778 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL21P46778 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL21P46778 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL21P46778 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL21P46778 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms