Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN7P41732 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN7P41732 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN7P41732 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN7P41732 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms