Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CPS1P31327 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CPS1P31327 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPS1P31327 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CPS1P31327 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CPS1P31327 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CPS1P31327 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CPS1P31327 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CPS1P31327 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CPS1P31327 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPS1P31327 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPS1P31327 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPS1P31327 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CPS1P31327 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CPS1P31327 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CPS1P31327 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CPS1P31327 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CPS1P31327 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CPS1P31327 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CPS1P31327 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CPS1P31327 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CPS1P31327 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CPS1P31327 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CPS1P31327 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CPS1P31327 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CPS1P31327 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CPS1P31327 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPS1P31327 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPS1P31327 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CPS1P31327 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPS1P31327 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPS1P31327 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CPS1P31327 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPS1P31327 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPS1P31327 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CPS1P31327 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPS1P31327 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPS1P31327 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPS1P31327 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPS1P31327 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPS1P31327 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CPS1P31327 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CPS1P31327 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CPS1P31327 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CPS1P31327 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPS1P31327 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPS1P31327 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPS1P31327 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CPS1P31327 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CPS1P31327 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CPS1P31327 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CPS1P31327 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CPS1P31327 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPS1P31327 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CPS1P31327 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPS1P31327 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPS1P31327 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPS1P31327 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CPS1P31327 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPS1P31327 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CPS1P31327 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPS1P31327 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CPS1P31327 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPS1P31327 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CPS1P31327 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CPS1P31327 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CPS1P31327 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CPS1P31327 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CPS1P31327 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CPS1P31327 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CPS1P31327 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CPS1P31327 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPS1P31327 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPS1P31327 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPS1P31327 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPS1P31327 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms