Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC13P31276 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC13P31276 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms