Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCAP28676 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCAP28676 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCAP28676 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GCAP28676 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCAP28676 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCAP28676 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCAP28676 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCAP28676 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCAP28676 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCAP28676 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCAP28676 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCAP28676 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCAP28676 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCAP28676 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCAP28676 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCAP28676 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCAP28676 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCAP28676 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCAP28676 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCAP28676 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCAP28676 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCAP28676 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCAP28676 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCAP28676 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCAP28676 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCAP28676 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCAP28676 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCAP28676 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCAP28676 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCAP28676 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCAP28676 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCAP28676 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCAP28676 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCAP28676 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCAP28676 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCAP28676 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCAP28676 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GCAP28676 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCAP28676 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCAP28676 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCAP28676 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCAP28676 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCAP28676 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCAP28676 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCAP28676 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCAP28676 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCAP28676 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCAP28676 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GCAP28676 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms