Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRR2P28476 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABRR2P28476 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRR2P28476 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR2P28476 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms