Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMBRP28336 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMBRP28336 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMBRP28336 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NMBRP28336 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NMBRP28336 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NMBRP28336 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NMBRP28336 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NMBRP28336 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NMBRP28336 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NMBRP28336 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NMBRP28336 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NMBRP28336 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NMBRP28336 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NMBRP28336 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NMBRP28336 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NMBRP28336 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMBRP28336 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NMBRP28336 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NMBRP28336 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NMBRP28336 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NMBRP28336 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NMBRP28336 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NMBRP28336 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMBRP28336 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMBRP28336 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMBRP28336 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMBRP28336 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NMBRP28336 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NMBRP28336 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NMBRP28336 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NMBRP28336 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMBRP28336 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMBRP28336 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMBRP28336 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMBRP28336 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMBRP28336 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMBRP28336 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBRP28336 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBRP28336 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBRP28336 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBRP28336 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBRP28336 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMBRP28336 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMBRP28336 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMBRP28336 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NMBRP28336 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMBRP28336 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBRP28336 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBRP28336 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBRP28336 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBRP28336 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBRP28336 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMBRP28336 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NMBRP28336 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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