Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP1P23763 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP1P23763 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms