Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TAF1P21675 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TAF1P21675 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TAF1P21675 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TAF1P21675 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TAF1P21675 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1P21675 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TAF1P21675 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TAF1P21675 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TAF1P21675 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1P21675 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1P21675 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1P21675 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1P21675 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1P21675 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1P21675 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1P21675 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1P21675 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1P21675 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1P21675 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1P21675 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1P21675 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1P21675 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TAF1P21675 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TAF1P21675 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TAF1P21675 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TAF1P21675 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TAF1P21675 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TAF1P21675 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TAF1P21675 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAF1P21675 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAF1P21675 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAF1P21675 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TAF1P21675 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TAF1P21675 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TAF1P21675 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1P21675 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1P21675 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1P21675 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1P21675 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1P21675 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1P21675 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1P21675 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1P21675 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1P21675 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TAF1P21675 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TAF1P21675 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TAF1P21675 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1P21675 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAF1P21675 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAF1P21675 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAF1P21675 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1P21675 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TAF1P21675 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TAF1P21675 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TAF1P21675 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TAF1P21675 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TAF1P21675 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TAF1P21675 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TAF1P21675 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TAF1P21675 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TAF1P21675 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAF1P21675 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms