Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPI1P17947 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPI1P17947 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPI1P17947 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPI1P17947 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPI1P17947 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPI1P17947 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPI1P17947 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPI1P17947 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPI1P17947 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPI1P17947 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPI1P17947 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPI1P17947 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPI1P17947 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPI1P17947 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPI1P17947 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPI1P17947 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPI1P17947 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPI1P17947 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPI1P17947 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPI1P17947 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPI1P17947 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPI1P17947 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPI1P17947 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPI1P17947 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPI1P17947 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPI1P17947 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPI1P17947 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPI1P17947 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPI1P17947 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPI1P17947 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPI1P17947 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPI1P17947 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPI1P17947 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPI1P17947 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPI1P17947 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms