Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHN1P15882 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHN1P15882 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHN1P15882 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHN1P15882 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHN1P15882 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHN1P15882 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHN1P15882 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHN1P15882 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHN1P15882 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHN1P15882 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHN1P15882 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHN1P15882 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHN1P15882 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHN1P15882 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHN1P15882 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHN1P15882 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHN1P15882 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHN1P15882 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHN1P15882 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHN1P15882 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHN1P15882 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHN1P15882 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHN1P15882 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHN1P15882 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHN1P15882 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHN1P15882 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHN1P15882 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHN1P15882 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHN1P15882 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHN1P15882 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHN1P15882 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHN1P15882 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHN1P15882 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHN1P15882 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHN1P15882 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHN1P15882 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHN1P15882 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHN1P15882 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHN1P15882 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHN1P15882 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHN1P15882 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHN1P15882 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHN1P15882 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHN1P15882 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHN1P15882 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHN1P15882 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHN1P15882 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHN1P15882 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHN1P15882 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms