Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BMP3P12645 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BMP3P12645 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BMP3P12645 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BMP3P12645 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BMP3P12645 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BMP3P12645 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BMP3P12645 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BMP3P12645 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BMP3P12645 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BMP3P12645 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BMP3P12645 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BMP3P12645 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BMP3P12645 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BMP3P12645 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BMP3P12645 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BMP3P12645 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BMP3P12645 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BMP3P12645 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BMP3P12645 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BMP3P12645 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BMP3P12645 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BMP3P12645 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BMP3P12645 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BMP3P12645 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BMP3P12645 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BMP3P12645 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BMP3P12645 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BMP3P12645 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BMP3P12645 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BMP3P12645 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BMP3P12645 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BMP3P12645 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BMP3P12645 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BMP3P12645 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BMP3P12645 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BMP3P12645 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BMP3P12645 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BMP3P12645 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BMP3P12645 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BMP3P12645 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BMP3P12645 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BMP3P12645 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BMP3P12645 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BMP3P12645 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BMP3P12645 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BMP3P12645 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BMP3P12645 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BMP3P12645 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BMP3P12645 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BMP3P12645 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BMP3P12645 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BMP3P12645 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BMP3P12645 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BMP3P12645 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BMP3P12645 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BMP3P12645 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BMP3P12645 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BMP3P12645 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BMP3P12645 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BMP3P12645 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BMP3P12645 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BMP3P12645 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BMP3P12645 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms