Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GLI3P10071 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GLI3P10071 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GLI3P10071 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GLI3P10071 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GLI3P10071 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GLI3P10071 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GLI3P10071 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GLI3P10071 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GLI3P10071 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GLI3P10071 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GLI3P10071 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GLI3P10071 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GLI3P10071 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLI3P10071 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GLI3P10071 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GLI3P10071 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLI3P10071 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLI3P10071 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLI3P10071 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLI3P10071 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLI3P10071 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLI3P10071 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GLI3P10071 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GLI3P10071 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI3P10071 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI3P10071 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI3P10071 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
GLI3P10071 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI3P10071 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI3P10071 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLI3P10071 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI3P10071 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLI3P10071 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GLI3P10071 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLI3P10071 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI3P10071 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI3P10071 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI3P10071 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI3P10071 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI3P10071 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLI3P10071 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI3P10071 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI3P10071 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI3P10071 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLI3P10071 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GLI3P10071 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI3P10071 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI3P10071 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI3P10071 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GLI3P10071 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI3P10071 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI3P10071 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI3P10071 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
GLI3P10071 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLI3P10071 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GLI3P10071 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GLI3P10071 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GLI3P10071 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GLI3P10071 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
GLI3P10071 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GLI3P10071 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GLI3P10071 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GLI3P10071 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GLI3P10071 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GLI3P10071 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GLI3P10071 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GLI3P10071 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GLI3P10071 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GLI3P10071 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GLI3P10071 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GLI3P10071 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GLI3P10071 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GLI3P10071 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
GLI3P10071 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GLI3P10071 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GLI3P10071 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GLI3P10071 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms