Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM3P06753 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM3P06753 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM3P06753 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM3P06753 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM3P06753 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM3P06753 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM3P06753 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM3P06753 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM3P06753 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM3P06753 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM3P06753 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM3P06753 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM3P06753 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM3P06753 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM3P06753 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM3P06753 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPM3P06753 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TPM3P06753 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPM3P06753 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM3P06753 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM3P06753 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM3P06753 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM3P06753 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM3P06753 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM3P06753 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM3P06753 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM3P06753 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM3P06753 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM3P06753 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM3P06753 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM3P06753 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM3P06753 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TPM3P06753 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM3P06753 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM3P06753 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM3P06753 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM3P06753 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM3P06753 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM3P06753 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM3P06753 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM3P06753 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM3P06753 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM3P06753 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM3P06753 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM3P06753 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM3P06753 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM3P06753 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM3P06753 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM3P06753 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM3P06753 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM3P06753 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TPM3P06753 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM3P06753 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM3P06753 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM3P06753 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM3P06753 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM3P06753 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM3P06753 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM3P06753 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM3P06753 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM3P06753 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM3P06753 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM3P06753 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM3P06753 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM3P06753 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM3P06753 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM3P06753 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM3P06753 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM3P06753 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM3P06753 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM3P06753 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM3P06753 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM3P06753 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM3P06753 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM3P06753 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPM3P06753 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TPM3P06753 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPM3P06753 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms