Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLA-DOAP06340 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HLA-DOAP06340 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HLA-DOAP06340 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HLA-DOAP06340 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms