Protein–RNA interactions for Protein: P01024

C3, Complement C3, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3P01024 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
C3P01024 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
C3P01024 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
C3P01024 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
C3P01024 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
C3P01024 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
C3P01024 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
C3P01024 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
C3P01024 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
C3P01024 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
C3P01024 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
C3P01024 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
C3P01024 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
C3P01024 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
C3P01024 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
C3P01024 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
C3P01024 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
C3P01024 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
C3P01024 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
C3P01024 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
C3P01024 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
C3P01024 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
C3P01024 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
C3P01024 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
C3P01024 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
C3P01024 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
C3P01024 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C3P01024 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C3P01024 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
C3P01024 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
C3P01024 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
C3P01024 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
C3P01024 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
C3P01024 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
C3P01024 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
C3P01024 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
C3P01024 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
C3P01024 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
C3P01024 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
C3P01024 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
C3P01024 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
C3P01024 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
C3P01024 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
C3P01024 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
C3P01024 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
C3P01024 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
C3P01024 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
C3P01024 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
C3P01024 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
C3P01024 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
C3P01024 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
C3P01024 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
C3P01024 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
C3P01024 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
C3P01024 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
C3P01024 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
C3P01024 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
C3P01024 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
C3P01024 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
C3P01024 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
C3P01024 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
C3P01024 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
C3P01024 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
C3P01024 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
C3P01024 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
C3P01024 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
C3P01024 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
C3P01024 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
C3P01024 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C3P01024 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
C3P01024 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
C3P01024 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
C3P01024 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
C3P01024 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
C3P01024 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
C3P01024 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
C3P01024 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
C3P01024 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C3P01024 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C3P01024 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
C3P01024 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C3P01024 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
C3P01024 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
C3P01024 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
C3P01024 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
C3P01024 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
C3P01024 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
C3P01024 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
C3P01024 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
C3P01024 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
C3P01024 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
C3P01024 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C3P01024 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C3P01024 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C3P01024 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C3P01024 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C3P01024 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
C3P01024 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
C3P01024 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C3P01024 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms