Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PCNTO95613 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCNTO95613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCNTO95613 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCNTO95613 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCNTO95613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCNTO95613 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCNTO95613 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCNTO95613 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCNTO95613 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCNTO95613 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCNTO95613 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCNTO95613 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PCNTO95613 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCNTO95613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCNTO95613 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCNTO95613 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCNTO95613 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCNTO95613 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PCNTO95613 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCNTO95613 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCNTO95613 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCNTO95613 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PCNTO95613 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCNTO95613 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCNTO95613 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCNTO95613 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PCNTO95613 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCNTO95613 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCNTO95613 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PCNTO95613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCNTO95613 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCNTO95613 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCNTO95613 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCNTO95613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCNTO95613 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCNTO95613 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCNTO95613 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PCNTO95613 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PCNTO95613 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNTO95613 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCNTO95613 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCNTO95613 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCNTO95613 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCNTO95613 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCNTO95613 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCNTO95613 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCNTO95613 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNTO95613 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNTO95613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNTO95613 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNTO95613 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNTO95613 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNTO95613 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNTO95613 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNTO95613 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNTO95613 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCNTO95613 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCNTO95613 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCNTO95613 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCNTO95613 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCNTO95613 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNTO95613 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNTO95613 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNTO95613 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNTO95613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNTO95613 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNTO95613 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCNTO95613 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCNTO95613 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCNTO95613 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNTO95613 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNTO95613 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNTO95613 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNTO95613 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNTO95613 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCNTO95613 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCNTO95613 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNTO95613 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNTO95613 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNTO95613 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNTO95613 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms