Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCC1O94876 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMCC1O94876 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms