Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6AO75865 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6AO75865 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms