Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCM2O75603 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCM2O75603 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCM2O75603 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCM2O75603 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM2O75603 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCM2O75603 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCM2O75603 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCM2O75603 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCM2O75603 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM2O75603 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCM2O75603 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCM2O75603 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCM2O75603 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCM2O75603 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCM2O75603 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCM2O75603 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GCM2O75603 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM2O75603 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM2O75603 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM2O75603 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM2O75603 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM2O75603 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM2O75603 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCM2O75603 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCM2O75603 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCM2O75603 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCM2O75603 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM2O75603 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM2O75603 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCM2O75603 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM2O75603 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms