Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COBLO75128 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COBLO75128 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COBLO75128 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COBLO75128 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COBLO75128 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COBLO75128 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COBLO75128 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COBLO75128 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COBLO75128 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
COBLO75128 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COBLO75128 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COBLO75128 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COBLO75128 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COBLO75128 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COBLO75128 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COBLO75128 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COBLO75128 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COBLO75128 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COBLO75128 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COBLO75128 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COBLO75128 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COBLO75128 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COBLO75128 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COBLO75128 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COBLO75128 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COBLO75128 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COBLO75128 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COBLO75128 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COBLO75128 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COBLO75128 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COBLO75128 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COBLO75128 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COBLO75128 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COBLO75128 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COBLO75128 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COBLO75128 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COBLO75128 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COBLO75128 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COBLO75128 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COBLO75128 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COBLO75128 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COBLO75128 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COBLO75128 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
COBLO75128 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COBLO75128 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COBLO75128 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COBLO75128 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COBLO75128 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COBLO75128 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COBLO75128 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COBLO75128 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COBLO75128 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COBLO75128 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COBLO75128 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLO75128 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLO75128 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLO75128 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLO75128 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLO75128 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLO75128 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLO75128 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLO75128 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLO75128 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLO75128 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COBLO75128 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COBLO75128 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COBLO75128 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COBLO75128 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COBLO75128 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COBLO75128 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLO75128 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLO75128 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLO75128 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLO75128 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COBLO75128 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COBLO75128 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COBLO75128 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLO75128 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COBLO75128 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms