Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCRIPO60506 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNCRIPO60506 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNCRIPO60506 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms