Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD5O60279 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD5O60279 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms