Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPAG9O60271 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SPAG9O60271 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SPAG9O60271 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SPAG9O60271 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms