Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9BO43861 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9BO43861 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP9BO43861 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms