Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD8O14715 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD8O14715 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD8O14715 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RGPD8O14715 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms