Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTLO00327 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARNTLO00327 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARNTLO00327 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARNTLO00327 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms