Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD11O00231 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD11O00231 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD11O00231 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD11O00231 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD11O00231 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD11O00231 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD11O00231 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD11O00231 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms