Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRK9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRK9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QRK9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QRK9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRK9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRK9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRK9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRK9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRK9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRK9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRK9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRK9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRK9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRK9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRK9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRK9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRK9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRK9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRK9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QRK9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QRK9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QRK9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QRK9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRK9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRK9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRK9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRK9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRK9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRK9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRK9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRK9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRK9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRK9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRK9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRK9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRK9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRK9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRK9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QRK9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
J3QRK9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
J3QRK9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRK9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRK9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRK9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRK9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRK9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRK9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QRK9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRK9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QRK9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms