Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STMND1H3BQB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMND1H3BQB6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STMND1H3BQB6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMND1H3BQB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMND1H3BQB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMND1H3BQB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms