Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF26H0Y7S4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF26H0Y7S4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF26H0Y7S4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF26H0Y7S4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms