Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8VRH5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F8VRH5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F8VRH5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F8VRH5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8VRH5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8VRH5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8VRH5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
F8VRH5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F8VRH5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F8VRH5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
F8VRH5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
F8VRH5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
F8VRH5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8VRH5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F8VRH5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8VRH5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8VRH5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8VRH5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8VRH5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8VRH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms