Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf58C9J3I9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf58C9J3I9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf58C9J3I9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms