Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF28PB7ZC32 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF28PB7ZC32 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF28PB7ZC32 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF28PB7ZC32 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF28PB7ZC32 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms