Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HACD1B0YJ81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD1B0YJ81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD1B0YJ81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD1B0YJ81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms