Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELOA3DA6NLF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3DA6NLF2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELOA3DA6NLF2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms