Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC5

C3orf70, UPF0524 protein C3orf70, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf70A6NLC5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf70A6NLC5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C3orf70A6NLC5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms