Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC160A6NGH7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC160A6NGH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC160A6NGH7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms